TRTOI 是一項自 2018 年啟動的多機構前瞻性世代研究，目的是深化對慢性腎臟病 (CKD) 致病機轉的理解，並改善台灣腎臟病患者的預後。研究以轉錄體學驅動 (transcriptomics-driven)的多體學方法為核心，結合機器學習，分析成人 (20 歲以上) 因臨床需要而接受腎臟切片或腎臟切除者的腎臟組織、尿液與血液檢體。
TRTOI 的三大任務：揭開驅動 CKD 惡化的機轉、精進臨床試驗的受試者篩選，以及提出假說以指引未來的介入性試驗。
資料如何收集
- 收案對象為臨床上具血尿、蛋白尿或不明原因腎功能異常、需接受腎臟切片者；排除末期重症或曾接受腎臟移植者。
- 在受試者同意下，額外採集一段腎臟組織核心 (core) 進行顯微解剖與 RNA 定序。
- 血液與尿液檢體處理後保存於 −80°C，並以 Olink® PEA 平台分析蛋白標記。
- 每年約收案 100–150 人，臨床結果追蹤至少 5 年。
多體學整合資源
TRTOI 整合了多種資料來源，建構完整的腎臟病研究平台：
結構化電子病歷腎臟切片轉錄體學血液／尿液生物標記蛋白體學 (Olink)數位病理腎臟超音波影像
資料治理與標準化
受試者的電子病歷、RNA-seq、數位病理與超音波資料，會安全傳輸至臺北榮總大數據中心，並分散於多台伺服器以確保穩定與防止遺失。資料遵循 OMOP CDM (Observational Medical Outcomes Partnership Common Data Model) 通用資料模型，以利跨系統整合、即時更新與互通性。研究團隊透過單一登入介面提供 PI／Co-PI 存取資料。
國際定位
TRTOI 與美國 KPMP、NEPTUNE 並列，是全球三大腎臟 RNA 資料庫之一，也是台灣健康大數據平台唯一入選的腎臟科資料，具高度的資料獨特性與產學價值。